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Ejercicio GEP-ISFG de interpretación de secuencias de ADNmt 2005-2006
Estimados compañeros:
Con la intención de seguir mejorando en lo concerniente al análisis de ADNmt y con la intención de poder obtener información que pueda ser útil para todos, nos gustaría proponer un ejercicio de interpretación de secuencias de ADNmt.
A continuación exponemos someramente en que consistiría el ejercicio:
En cada uno de los zips se encuentran los raw data de las distintas muestras implicadas en los diferentes ejercicios. Asimismo se adjunta el archivo correspondiente a la matriz con que dichos raw data fueron generados, por si algún laboratorio lo requiriera. Normalmente para cada muestra tendremos 4 raw data, correspondientes a las lecturas “forward” y “reverse” de las regiones HV1 y HV2. Determinadas muestras han requerido secuenciaciones adicionales para definir ciertas regiones (tracto poliC de HV1) en éstas encontraremos 6 raw data. Cada raw data está descrito atendiendo al siguiente código:
Por ejemplo: M3.1HV1for15997
M3.1: Identificación de la muestra
HV1: región analizada
For: dirección de lectura (“forward)
15997: Posición de hibridación del primer empleado
Ejercicio 1 (zip - 1.292 Kb)
Ejercicio 2 (zip - 839 Kb)
Ejercicio 3 (zip - 1.667 Kb)
Matriz (zip - 514 b) Esperamos que este ejercicio que os planteamos resulte interesante para vosotros y os pediríamos que todos aquellos laboratorios que deseen participar nos lo comuniquen antes del día 15 de diciembre de 2005 a la dirección de correo: [email protected].
No olvidéis enviar cumplimentado el archivo que se adjunta “Formulario de participación ejercicio interpretación ADNmt GEP 2005-2006”. Para cualquier consulta que queráis realizar no dudéis en contactar con nosotros.
Muchas gracias a todos Grupo de ADNmt del GEP-ISFG |
